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生物安全运输箱基本上的三层包装系统：在传染性及潜在性传染性化学物质运送中挑选应用的三层包装系统。这一包装系统由三层构成：内层容器，第二层包装及其表层包装。
生物安全运输箱运载标本采集的内层容器(主容器)务必防水、防漏并贴上标示內容物的适度标识。内层容器外边要包囊一定量的速即原材料，便于内层容器摆脱或泄露时，能消化吸收外溢的全部液态。
防水、防漏的第二层包装(輔助包装原材料)用于包囊并维护内层容器。有一些包装好的内层容器可以放到单独的第二层包装中。有一些要求中包含了传染性化学物质包装的容积及净重程度。
1、首层包装规定用储存生物标本的初始容器，需将盖口密封性。
功效：盛装菌(毒)种或样版;
材料：夹层玻璃、金属材料或塑胶;
规定：密封性、无菌检测、“两耐”、“三防”;
标识：类型、识别码、名字、容积(贴到主容器外)。
2、第二层包装可以选用专用型二级包装桶或耐髙压包装袋。
功效：包装及维护主容器;
规定：“两耐”、“三防”;
材料：总数、危险因素声明、试品鉴定、推送/接受者信息内容(置防水袋内，贴到輔助容器外)。
3、第三层包装是将密封性好的第二层包装放进运送包装盒，运输包装盒规定有维持冷冻超低温作用。
功效：外维护;
规定：具备充分的抗压强度;
标志：生物危险、警示、提醒、置放方位(应用冰块时，应留出排出气孔)。
